所谓的医保卡门槛费就是医保的起付线，即城镇职工、居民医保住院医疗费用起付标准。 如果是低于住院保险门槛费用的，那么是不在保险范围之内的，只能够按照病人自费费用进行扣除，参保人员只有在住院医疗费用超过起付标准后，超过起付标准的部分才可报销住院医疗费用，而起付标准以下的住院医疗费由病员个人负担。
1.先以参保人的名义写一份申请书，写给户口所属区域的社保管理处；
2.治疗这个疾病的门诊病历记录（两年或近一段时间）；
3.必须要因这个疾病两年内住院记录，包括出院小结，原件及复印件；
4.出院病历中的相关资料复印件（医院帮忙复印的人知道哪些内容的），必需加盖那个医院的红章；
5.由到户口辖区社保处填写“重症申请表”；
6.连同以上资料，送区域社保管理处医保科予以审核；
7.区域社保审核通过后，会给一张表，再到指定医院鉴定；
8.鉴定医院盖章后，到区域社保复审，交一张一寸登记照片，并告诉要指定就诊的医院 。买病历，盖章，就行了。
这个要根据各地方的规定，因为各地方的标准不同，有的是800元，有的是1000元，超过了这个门槛后就可以按照比例报销。