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两方面不一样，一是开放时间不一样，东线全天西线夜游，二是线路不同。
具体而言，内河东线游船从夫子庙前天下文枢牌坊下的泮池登船，经过桃叶渡——白鹭洲公园——水街——东水关——中华门等地点，最后回到泮池码头下船 ；
内河西线夜游18：00开始，游船从泮池码头登船，沿途经过中华门——古戏台——仙鹤桥——西水关，回到泮池码头下船。
秦淮河周边景点，夫子庙白鹭洲公园，王导谢安纪念馆，瞻园，是一座历史悠久的江南私家园林，内有琳琅满目的风景，太平天国展览馆，煦园遗址，夫子庙展览馆，李香君故居，中华门城堡江南贡院考秀才的地方。