在柜台跨行转账是需要手续费的。一般不同银行有不同的跨行手续费收取标准，柜台跨行转账手续费与转账额度有关。以中国银行为例：
1、转账金额不超过两千元：柜台转账手续费按2元/笔收取。
2、转账金额在两千到五千元之间：柜台转账手续费按5元/笔收取。
3、转账金额在五千到一万元之间：柜台转账手续费按10元/笔收取。
4、转账金额在一万到五万元之间：柜台转账手续费按15元/笔收取。
5、转账金额在五万元以上：柜台转账手续费按转账金额的0.03%收取，最高收50元。
银行柜台跨行转账需要手续费，不同的银行收费标准是不一样的，具体可以电话咨询银行；比如建设银行通过柜台跨行转账在5000元以下会收取手续费2元，5000元到10000元会收取10元手续费。这样看通过银行柜台转账成本比较高。