在医院使用社保卡进行结算时，费用扣除的来源取决于社保卡的类型和使用的功能。根据搜索结果：
如果使用的是具有金融功能的社保卡，那么费用将从社保卡中的医保功能部分扣除，不会影响到卡内的银行卡余额1。
医保卡分为个人账户和统筹账户。个人账户中的资金可以用于支付门诊费用或购买药品，这部分费用是直接从个人账户中扣除的2。
统筹账户则包含一个额度，用于特殊门诊或住院医疗费用的报销。当使用统筹账户的额度时，并不是从账户余额中扣除，而是使用这个额度23。
对于住院费用，个人应负担的部分需要个人直接支付给医院，而医保基金负担的部分则由经办机构与医院结算。住院费用的医保卡扣费通常是出院时一次性扣除的4。
综上所述，使用社保卡在医院结算时，费用的扣除可能涉及个人账户的资金，也可能通过统筹账户的额度进行支付，具体取决于社保卡的类型和使用的功能。
根据我所了解的情况，医院通常接受大额医保卡来支付药费并进行报销。大额医保卡是一种特殊的医保支付方式，可以用于支付较高金额的医疗费用。当患者使用大额医保卡在医院购买药物时，医院会根据相关规定进行报销程序，将药费退还给患者或直接扣除药费。然而，具体的政策和操作可能因地区和医院而异，建议您在就诊前咨询医院或医保部门以获取准确的信息。
准确的说刷医保卡一般就是等于报销，报销之后，医疗保险部门将不再给你报销。医疗保险卡上的钱能够用来在指定药店购买药品，支付门诊和急诊费用，但不属于报销范围，因为医疗保险卡上的钱是医疗保险个人账户上的钱。
在定点医院就医的时出示医保卡证明参保身份和挂号，个人不需要先支付再报销，直接便可由医保和医院结算该医保报销的部分，只有在结帐的时候，自付的部分由自己用医保卡余额或者现金支付。