首先乌龟真菌使用抗真菌类药物治疗，比如说可以使用达克宁药膏，药物均匀的涂抹于患处，每日1-2次，一般需要三个月才能见到疗效，真菌感染严重的，需要全身应用抗真菌药物。
其次如果说是水龟或者是半水龟，那必须要干养，另外就是一定要把生病的乌龟隔离起来饲养。
2 麝香龟真菌外观呈现灰色或者棕色，表面覆盖有一层黏液，通常生长在潮湿的地方，如河流边缘、泥土中等。
3 除了观察外观和生长环境，还可以通过采集样本，进行实验室化验，以确认其是否为麝香龟真菌。
需要注意的是，进行采集和实验室化验需要专业人员指导和操作，不可盲目进行。
龟龟容易感染真菌的原因有多种，一种是因为龟龟常年生活在温暖潮湿的环境中，容易滋生细菌，所以龟龟感染的几率增大。
二是水质的原因引起的，长时间不换水，导致水中杂物，粪便过多，引起细菌大量繁殖，导致龟龟受到侵害。